2.脱离隶属带来的人员效能问题。核算中心的设立势必带来会计人员与基层工会隶属关系的脱离，有可能引起人员懈怠，延误工作，甚至有意刁难的问题。为杜绝这一现象，加强核算中心人员绩效管理，制定一套完善的工作管理办法和工作绩效承诺制度，是持续深化核算中心运作的有效途径和唯一出路。

　　3.实行代理核算的会计责任问题。由于会计核算主体不变，基层工会负责人依然要对其会计工作的真实性、合法性负领导责任，核算中心及其具体会计人员承担相应的会计领导和具体经办责任。基层工会不能错误理解会计代理的本质，以为交由上级代理了就与我无干，放任不理，应该充分利用其核算主体地位、发挥本级经审组织职能作用，加强对核算中心代理记账工作进行依法有效的监督。