传统卫生院院长的主要职责受到传统计划经济体制以及后来市场竞争经济的深入影响，卫生院的主要功能及其职责也发生变化。传统卫生院院长的认定基本上是受上级卫生行政主管部门直接任命，其中主要职责与卫生院的功能性质直接相关。在计划经济体制下，卫生院属于差额拨款事业单位，注定了卫生院要以经济效益为主、社会效益为辅的功能模式，同时兼顾国家卫生政策;在市场经济体制下，受到经济潮流及竞争市场的冲击，卫生院面临倒闭、破产、改制的境地，卫生院出现以租赁、转让、承包、科室外租等多种形式办院，呈现出百花齐放的态势，各式各样的经营管理模式充斥医药市场，虽然某种程度上给卫生院带来了发展，但是收效甚微，只是出现极少数的活力势头，绝大部分卫生院依然是食不果腹、衣不遮体;但是也呈现了一批所谓的成功院长人士与成功经验，不过此时的卫生院公益性质发生改变，群众就医用药受到极大负面影响，以药养医、大处方、乱检查以及某些恶性竞争，不仅导致卫生资源的极大浪费，而且进一步导致了群众看病难、看病贵的问题日趋严重。这给后来的医改带来了巨大的考验，甚至后来广大的群众对医药体制改革出现了观望与期待的心理思维。

　　如此之下的卫生院院长主要职责，除了应对国家相关卫生政策外，主要转变在抓医院管理以促进医院经济效益，即以创收为主，所谓的创收能人，成为了卫生院的领头羊，而坚守在大多数偏远山区、规模较小的卫生院院长成了新时代的活雷锋，形成了一面是经济建设的楷模、一面是精神文明守候的榜样，两大阵营的出现，形成了卫生院发展极其不合理、不科学的格局。此种格局的出现，主要有来自国家体制的影响，也与部分地方因素有关。

　　三、公益性为主导下的卫生院功能转换对卫生院院长的影响。

　　近年来，受到国家新的医改政策影响，所有医疗机构均需回归其公益性、回归政府主导、回归服务百姓为主。国家实施全面的深化医药卫生体制改革，在一系列保基本、强基层、建机制的医改政策下，带动了卫生院的补偿机制、管理体制和运营机制的转变，也进一步影响到卫生院院长的角色定位及卫生院的功能定位，同时也影响到基层卫生院院长的个人思维，甚至极大的影响到卫生院院长的走向，即所谓的何去何从。新形势的卫生院，需要从事以公共卫生服务为主的功能，使得卫生院的出发点与传统管理模式发生巨大转换。卫生院院长的主要职责也与以往不同，不仅是行政上的管理者，还要兼顾财务、人事、医改新政等工作职责，责任性与风险性增加，观念也需日益更新，诸如卫生院的人事改革、绩效报酬制度改革、硬件软件建设、公共卫生服体系、乡村卫生一体化、新农合等等工作均需兼顾，在某种程度上，给卫生院长带来巨大的思想压力与工作负荷。

　　同时，在公立医疗机构公益性大旗之下，对公立医疗机构将采取由政府合理确定人员编制、工资水平、经费标准，明确收支范围和标准，药品、器械、设备由政府集中招标采购，按国家规定核定的基本建设、设备购置标准投入等等系列管理措施。这样，院长们的人权、财权、物权，几乎全部没有了，这些权力的行使需要请示相关主管部门的领导，那么院长们如果希望自己的医院能够获取更多的资源，怎么办?靠好好经营医院来赚钱是不可能的了，因为是公益性的，不能赚钱，那么就只能靠公关主管部门了。这种情况下，院长们需要天天围绕着那些拥有资源分配权的部门领导，比如拨款是采取标准的下限还是上限，也许会通过谈判交流等非科学、不合理手段方式。如此之下，将会出现难以预测的不良结果，这样一来，可能就毁掉了一批院长。因为院长本来应该是好好经营医院，提高医院市场竞争力的`，而在这种制度设计下，他不得不成了一个公关院长。这种体制下的管理与经营模式不得不引起相关部门的深思，如何预防与打击不良行为，以及如何面对诸如道德、法律、舆论方面的压力，亦将成为相关人员研究的课题，诸如这些，也给卫生院及院长带来考验与压力。

　　四、影响卫生院院长的其他要素。

　　1、人事问题。卫生院需要发展，关键在于人才。人才的合理选择以及人事制度改革在当前受到考验。以往个别通过关系化、人情化、私下协议化的人事制度，将受到冲击;同时诸多在同等条件下，长期工作在艰苦与特殊岗位的卫生人才队伍，包括卫生院院长，也随之浮躁起来，开始寻求更趋于合理、合情、平等、适合自我发展的岗位。这样不仅是医改体制需要，也是人性本身的需求，更重要的是社会主义民主政治建设的需要与政府职能部门执政的需要。如此，将打破以往人事格局，进一步向更加公平、公正、合理的人事制度建设框架迈入，有利于人才的选拔与应用，有利于社会的稳定和谐建设。否则，将成为社会一个不稳定、不和谐的因素，而导致不良的后果。